哈尔滨师范大学国旗护卫队在学校学生工作部（学生处、武装部）和学校团委共同指导下的学生组织，主要工作是学校升降旗等重要军礼仪仗任务，新生军训工作，开展各项爱国主义教育主题活动和助力精神文明建设等。是一个纪律严明、作风硬朗、团结友爱的半军事化校级学生组织。

国旗护卫队设队长、指导员、教官、副队长；下设办公室、作训部、宣传部、组织部、外联部。